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细菌物种界定新标准提出

2018-11-27 17:56:44

细菌物种界定新标准提出

本报讯(张好成通讯员乔蕤琳、聂松义)近日,由哈尔滨医科大学基因组中心主任刘树林指导的科研小组,针对半封闭基因池模型提出了界定细菌物种的3Cs标准。该标准是用于细菌自然分类的真正意义上的客观标准,可科学指导医生的临床诊断和治疗,并可用于对以往细菌物种和待定细菌物种的判定。 有些医生可能会困惑为什么有些肠沙门菌会引起胃肠炎但无需治疗,而另一些却可引起致命的伤寒病。有了3Cs标准,医生的困惑就可迎刃而解了。按照3Cs标准,虽然胃肠炎和伤寒病均由肠沙门菌引起,但它们是由不同的细菌物种感染所致,如引起胃肠炎的是鼠伤寒沙门菌等细菌,而引起伤寒病的则是伤寒沙门菌。 3Cs标准具体内容为:同一物种的所有成员亲缘关系密切、近缘但是不同物种之间有清晰的遗传边界、同一物种的所有成员具有共同的生物学特性,而这些特征性的生物学特性不见于任何其他物种。因三条标准的英文表述都由字母C开头,因此称作3Cs标准。 起初细菌的物种主要根据细菌形态、生化反应、血清学试验等表型性状来界定。上世纪70年代起,人们把DNA杂交率70%作为细菌物种的界限。1980年前后,美国科学家CarlWoese把16SrRNA序列相似度97%作为细菌物种的界限。此后,这两项指标成为定义细菌物种的金标准。但这两项指标都是连续性的,其中70%和97%为人为硬性界定,缺乏可信服的科学依据。 此次提出的3Cs标准不但可明确界定细菌的物种,而且阐明了为什么如此界定。据悉,相关论文已被伯杰氏国际系统微生物学学会期刊接收,即将刊出。

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